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上海各个区或开发区在公司注册费用、税收优惠政策、行业发展规划、一般纳税人申请政策等方面有很大的差异。因此，需要结合自己企业的实际情况而选择最适合自己的开发区来上海注册公司。
一、贸易型公司
贸易型公司基本上都要开增值税专用发票。因此，一般纳税人申请政策的宽松是大家必须要考虑的问题。从税收优惠政策及一般纳税人资格申请政策综合比较，金山的开发区最适合。
1、一般纳税人资格政策最为宽松
注册资本3万10万都可以申请一般纳税人资格，而且对于办公场地的要求也很宽松，办公场地为住宅也可以。
备注：2014年3月1日以后，注册资本已全面实行认缴制，绝大部分公司注册已无需验资，并且取消最低注册资本及首次出资额度的限制。
2、贸易型公司返税优惠政策上海最高
贸易类公司的税收优惠政策，金山和崇明的返税比例是一样的，为上海最高。增值税返实际交税额的7%，企业所得税返实际交税额的16%。
3、政府财政补贴公司注册费用
金山区政府对于在本区投资或创业的企业在公司注册登记上有财政补助的，公司注册资本在50万及其以下的，全额补贴工商、税务等行政收费。
4、公司注册、纳税申报、年检全程服务
二、纳税额大的企业
纳税额大的企业必须优先考虑税收优惠政策。税收筹划、合理节税是企业长远发展的需求。从上海的返税优惠政策角度来看，在崇明或金山注册公司最为合适，这2个区的返税在上海是最高的。
1、营业税返税比例
明对于营业税的返税比例起始为40%，金山为35%。也就是说，您的企业缴纳100元的营业税，您得到的返税至少为：崇明40元，金山35元。上海其它区的开发区对于营业税的返税都在30%以下。
2、增值税返税比例
崇明和金山对于增值税的返税比例都一样，为企业实际交税额的7%。
3、企业所得税返税比例
崇明和金山对于企业所得税的返税比例都一样，为企业实际交税额的16%。
4、返税方式与返税时间
这2个区都是由区财政局直接返税给企业，而不是通过开发区或代理公司。 金山的返税时间为隔月返还，崇明的返税时间为季度返还。
三、合伙企业或个人独资企业
对于纳税额大的合伙企业或个人独资企业，从税收优惠政策角度来看，在金山或崇明注册公司较为合适。纳税额不大的合伙企业可以考虑就近原则。
此外，纳税额大的咨询服务类公司也可以考虑注册合伙企业。
注册合伙企业在节税上的优势：
1、没有企业所得税
合伙企业和有限公司不一样。有限公司要交纳25%的企业所得税，而合伙企业只需缴纳营业税，没有企业所得税。
2、个人所得税可以申请核定征收
有限公司的股东分红要交纳20%的税，而合伙企业可以个人所得税核定征收，一般咨询服务类企业的个人所得税核定征收税率为6%
从上述2点我们可以开出合伙企业在节税上的巨大优势。
需注意的是，合伙企业的注册资本无需实际出资（无需验资）。但是，合伙企业承担的是无限连带责任，而有限公司承担的是有限责任。
建筑设计、规划设计、投资管理、广告公关等咨询服务类合伙企业在金山或崇明设立企业，除了达到合理节税的优惠政策，还可以享受高额的返税优惠政策。
四、大学生创业注册公司
近几年来，在上海创业的大学生越来越多。大学生创业建议在嘉定区注册公司最为合适。
嘉定区对于大学生创业注册公司提供免除工商、税务等公司注册行政收费的优惠政策。
五、外贸企业
对于从事进口业务的外贸公司，建议实地注册，即自己租赁办公室注册公司。
涉及到出口退税问题，绝大多数上海的开发区是不接受外贸公司注册登记的。有一些开发区接受外贸公司注册，但是，在出口退税方面，地方承担的出口退税(占整体退税额的7.5%)是不退给企业的。
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